应用案例

• HCC肿瘤微环境中MAIT细胞的异质性

  美国国立卫生研究院、国家癌症研究所癌症研究中心Tim F. Greten教授及其团队通过多组学技术（scRNA-seq、CODEX、FACS）联用，分析了HCC中MAIT细胞的异质性和功能障碍，以及它们浸润肝肿瘤的能力缺陷。邻近肝脏的共定位以及占据空位的CSF1R+PD-L1+肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)与MAIT细胞的相互作用被认为是MAIT细胞功能障碍的关键调节因素。在体外共培养研究中，使用患者样本和小鼠模型对这种细胞-细胞相互作用的扰动重新激活了MAIT细胞的细胞毒性。这些研究表明，aPD-1/aPD-L1治疗针对HCC患者的MAIT细胞。

  
• 空转Visium与CODEX的强强联合发现胶质母细胞瘤具有多层结构

  空间多组学的发展使研究人员能够对细胞类型和细胞状态进行精细的原位空间映射。2024年4月22号，来自以色列魏茨曼科学研究所的Itay Tirosh教授团队通过空转 10x Visium （19个GBM样本）和空间蛋白组CODEX（12个GBM样本）对GBM开展了全面和深度的空间原位分析，揭示了GBM由结构化区域和无序区域组成；结构化区域包含了与缺氧相关的五个层次的组织结构；发现了经典组织病理学无法识别的区域特征。

  
• Nature|单细胞和空间组学联合绘制史上最大规模人类乳腺细胞图谱

  首次使用单细胞和空间组学联合绘制史上最大规模人类乳腺细胞图谱，增进了对人乳腺组织中上皮细胞和非上皮细胞类型的了解，为研究乳腺生物学、发育和乳腺癌等疾病提供了全面的参考。

  
• Cell | 依赖于TCF4的基因调控网络帮助黑色素瘤抵抗免疫治疗

  在接受ICB治疗后，患者MES黑色素瘤细胞数量显著增加，TCF4是相关调控网络的关键因子。靶向TCF4可以提高黑色素瘤细胞对靶向治疗和ICB治疗的敏感性和免疫原性。该研究揭示了一个依赖TCF4的基因调控网络，其在黑色素瘤抵抗靶向治疗和ICB治疗中起着重要作用。